LIC lance SSAM – un pas vers de meilleures prédictions animales

LIC a publié son nouveau modèle animal en une seule étape (SSAM) qui utilise les informations génomiques animales de manière plus efficace.

LIC a investi plus de 70 millions de dollars au cours des trois dernières décennies pour accroître la précision de son système d'évaluation des animaux avec des données améliorées fournissant de meilleures prédictions pour la valeur de la reproduction pour nos agriculteurs.

Février 2020 a vu LIC publier son nouveau modèle animal en une seule étape (SSAM) qui utilise informations génomiques animales d'une manière plus efficace - en combinant l'ascendance, les informations phénotypiques et génomiques en une seule étape. Cela améliore l'efficacité du programme d'élevage de LIC, car nous travaillons à identifier les taureaux dont les filles seront les vaches les plus rentables et les plus efficaces à la ferme.

Pâturage de vaches laitières LIC

Des différences existent actuellement entre NZAEL BW, qui n'inclut pas d'informations génomiques, et les résultats de mérite génétique de LIC (gBW), qui le font. LIC gBW utilise le nouveau LIC SSAM et contient une composante d'informations génomiques incluses pour les valeurs d'élevage et la valeur d'élevage, qui restent tout au long de la vie d'un animal, y compris celle des taureaux éprouvés par des filles.

La responsable technique de l'amélioration du troupeau pour le LIC, Rachel Bloxham, explique : « Plus il y a de vaches génotypées, plus nous avons d'informations et plus nos prévisions seront précises pour garantir que nous continuons à soutenir l'élevage de vaches rentables et efficaces qui convertiront les aliments en profit. pour les producteurs laitiers d'aujourd'hui et de demain. Le nouveau modèle est peut-être le plus grand pas en avant dans l'évaluation des animaux depuis l'introduction de Breeding Worth en 1996 - c'est un développement passionnant.

FAQ sur le modèle animal en une étape :

Voici quelques questions fréquemment posées. Si vous en avez d'autres, veuillez contacter votre représentant LIC local.

Quelle est la différence entre le nouveau modèle et l'ancien modèle ?

Un aspect clé est la manière dont les données sont analysées dans le nouveau modèle. Le modèle animal en une étape analyse simultanément l'ensemble de la population laitière néo-zélandaise (environ 30 millions d'animaux décédés et actuels, génotypés et non génotypés), ce qui permet de bénéficier des données génomiques pour une plus grande proportion de la population.

Pourquoi les taureaux ont-ils un poids corporel différent sur le site Web de LIC par rapport à celui de NZAEL ?

Alors que les deux systèmes d'évaluation (NZAEL 2.0 et SSAM) utilisent les mêmes informations sur l'ascendance et le phénotype, la valeur d'élevage LIC (gBW) et les valeurs d'élevage contiennent également des informations génomiques, contrairement aux résultats de NZAEL actuellement.

Pourquoi les valeurs d'un animal peuvent-elles être affectées par la génomique alors que l'animal n'a pas été génotypé ?

L'ascendance et les relations connues avec un animal jouent un rôle essentiel dans tout système d'évaluation des animaux. Ce n'est pas différent avec l'inclusion des données génomiques. Le nouveau modèle animal en une seule étape utilise toutes les informations (production, TOP, génomique, pedigree) pour tous les animaux (toutes races, historiques, actuels, génotypés, non génotypés) en une seule étape, ce qui entraîne le flux d'informations génomiques sur plusieurs générations, de haut en bas du pedigree.

Le nouveau modèle est-il meilleur que le modèle précédent

Oui. La validation par les scientifiques du LIC des cohortes à 11 codes, 12 codes, 13 codes et 14 codes du Sire Proving Scheme du LIC (ces animaux ont maintenant des filles avec des données de contrôle laitier) montre que l'utilisation du nouveau modèle animal en une seule étape a a entraîné une augmentation de 8 % de la précision de la prédiction du mérite génétique (c'est-à-dire en comparant les prédictions génomiques aux épreuves filles réelles).

Le gBW des taureaux augmente-t-il ou diminue-t-il avec l'inclusion d'informations génomiques ?

Les données génomiques ne sont qu'un autre élément d'information utilisé dans l'estimation du mérite génétique d'un animal. L'inclusion de la génomique peut entraîner une augmentation du gBW d'un animal or bas. Le résultat est des estimations plus fiables pour tous les taureaux génomiques.

Pourquoi le LIC inclut-il encore des informations génomiques chez les taureaux éprouvés par des filles ?

L'inclusion d'informations génomiques avec des taureaux déjà éprouvés par des filles donne au LIC des informations supplémentaires sur les caractères à maturation plus lente comme la fertilité et la longévité.

Au fur et à mesure que les filles d'un taureau terminent des lactations supplémentaires et que nous obtenons plus de données phénotypiques, la quantité d'influence génomique diminue.

Pour les traits où le phénotype fille est mesuré plus tard dans la vie, il faut plus de temps pour que les informations fournies par la génomique soient dominées par les données phénotypiques.

Sur quelle mesure LIC commercialise-t-il ses taureaux ?

LIC commercialise des taureaux sur gBW. Nous continuerons à sélectionner des taureaux sur un large éventail de traits dans le but de fournir aux producteurs laitiers les meilleurs taureaux pour atteindre leurs objectifs d'élevage individuels.

Les informations génomiques antérieures étaient-elles inexactes ?

Non - les modèles précédents ont produit des résultats positifs, comme en témoigne le nombre de taureaux LIC figurant actuellement sur la liste RAS.

Ces taureaux ont été élevés et achetés sur les modèles génomiques précédents. Au fur et à mesure que la science progresse et que notre ensemble de données d'animaux génotypés continue de croître, nous continuerons d'apporter des itérations au modèle pour améliorer la précision de la sélection génomique.

Comment les données génomiques améliorent-elles la précision de la prédiction du mérite génétique d'un animal ?

Une population de référence d'animaux bien enregistrés qui ont été génotypés, comprenant à la fois des femelles et des mâles éprouvés, ce qui nous permet de prédire l'impact de divers effets SNP.

Le génotypage nous fournit des informations sur les allèles/gènes qu'un animal a effectivement reçus de ses parents et les effets SNP connus peuvent être utilisés dans son évaluation. La population de référence du LIC comprend plus de cent mille animaux.

La génomique fournit une estimation des gènes « bons » ou « mauvais » dont l'animal a hérité bien avant que ses propres performances, ou celles de sa progéniture, puissent être mesurées. Là où nous n'avons pas beaucoup de progéniture (ce qui est généralement le cas pour les vaches), la génomique nous aide à mieux comprendre quelle proportion de la supériorité de performance d'un animal sera héritée par sa progéniture.

Si vous avez d'autres questions, veuillez contacter votre Responsable des solutions agricoles LIC

par Katrina Younger
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